| Line
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Route
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| Belfort – Delle
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Belfort ... Delle
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| Belfort – Épinal
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Belfort ... Lure ... Épinal (see TER Grand Est line L5 for details)
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| Belfort – Vesoul
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Belfort ... Lure – Vesoul
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| Besançon – Belfort
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Besançon-Viotte ... Montbéliard ... Belfort
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| Besançon – Besançon TGV
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Besançon-Viotte – École-Valentin – Besançon Franche-Comté TGV
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| Besançon – Bourg-en-Bresse
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Besançon-Viotte ... Mouchard ... Lons-le-Saunier ... Bourg-en-Bresse
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| Besançon – La Chaux-de-Fonds
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Besançon-Viotte ... Le Valdahon ... Morteau ... La Chaux-de-Fonds (Switzerland)
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| Chalon-sur-Saône – Montchanin
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Chalon-sur-Saône ... Montchanin
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| Dijon – Auxerre
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Dijon ... Montbard ... Laroche-Migennes ... Auxerre
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| Dijon – Besançon
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Dijon ... Dole-Ville ... Besançon-Viotte
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| Dijon – Bourg-en-Bresse
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Dijon ... Saint-Jean-de-Losne ... Louhans – Saint-Amour – Bourg-en-Bresse
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| Dijon – Is-sur-Tille
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Dijon ... Is-sur-Tille
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| Dijon – Lyon
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Dijon ... Beaune ... Chalon-sur-Saône ... Mâcon-Ville ... Villefranche-sur-Saône ... Lyon-Part-Dieu
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| Dijon – Nevers
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Dijon – Beaune – Montchanin ... Étang-sur-Arroux ... Decize ... Nevers
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| Dole – Pontarlier
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Dole-Ville ... Mouchard – Andelot ... Frasne ... Pontarlier
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| Laroche – Corbigny
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Laroche-Migennes – Auxerre ... Cravant-Bazarnes ... Clamecy ... Corbigny
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| Mouchard – Saint-Claude
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Mouchard – Andelot ... Champagnole ... Morez ... Saint-Claude
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| Moulins – Dijon
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Moulins-sur-Allier ... Paray-le-Monial ... Montchanin - Beaune - Dijon
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| Nevers – Clermont-Ferrand
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Nevers ... Moulins-sur-Allier ... Vichy ... Clermont-Ferrand (see TER Auvergne-Rhône-Alpes line 14 for details)
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| Nevers – Cosne-sur-Loire
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Nevers-le-Banlay ... Nevers ... La Charité ... Cosne-sur-Loire
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| Nevers – Lyon
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Nevers ... Moulins-sur-Allier ... Paray-le-Monial ... Lamure-sur-Azergues ... Lozanne ... Lyon-Perrache
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| Paris – Avallon
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Paris-Bercy – Sens ... Laroche-Migennes – Auxerre ... Avallon
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| Paris – Dijon
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Paris-Bercy – Sens ... Laroche-Migennes ... Tonnerre ... Montbard – Les Laumes-Alésia – Dijon-Ville
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| Paris – Laroche-Migennes
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Paris-Lyon – Melun ... Montereau ... Sens ... Laroche-Migennes
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| Pontarlier – Vallorbe
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Pontarlier – Frasne – Labergement-Sainte-Marie – Vallorbe (Switzerland)
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