Teymuraz Gabashvili was the defending champion, but chose not to defend his title.
| Singles | |
|---|---|
| 2016 Samarkand Challenger | |
| Champion |  Karen Khachanov |
| Runner-up |  Rubén Ramírez Hidalgo |
| Score | 6–1, 6–7(6–8), 6–1 |
Karen Khachanov won the title after defeating Rubén Ramírez Hidalgo 6–1, 6–7(6–8), 6–1 in the final.
Seeds
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Karen Khachanov (champion)
Radu Albot (quarterfinals)
Amir Weintraub (quarterfinals)
Jordi Samper Montaña (second round)
Farrukh Dustov (first round, retired)
Dmitry Popko (second round)
Nikola Milojević (first round)- Enrique López Pérez (first round)
Draw
editKey
edit- Q = Qualifier
- WC = Wild card
- LL = Lucky loser
- Alt = Alternate
- SE = Special exempt
- PR = Protected ranking
- ITF = ITF entry
- JE = Junior exempt
- w/o = Walkover
- r = Retired
- d = Defaulted
- SR = Special ranking
Finals
edit| Semifinals | Final | ||||||||||||
| 1 | Karen Khachanov
| 6 | 0 | ||||||||||
 Agustín Velotti
| 2 | 0r | |||||||||||
| 1 | Karen Khachanov
| 6 | 66 | 6 | |||||||||
| Rubén Ramírez Hidalgo
| 1 | 78 | 1 | ||||||||||
| Rubén Ramírez Hidalgo
| 2 | 77 | 77 | ||||||||||
 Ramkumar Ramanathan
| 6 | 65 | 60 | ||||||||||
Top half
edit| First round | Second round | Quarterfinals | Semifinals | ||||||||||||||||||||||||
| 1 | K Khachanov
| 6 | 7 | ||||||||||||||||||||||||
| Q |  Francesco Vilardo
| 2 | 5 | 1 | K Khachanov
| 6 | 6 | ||||||||||||||||||||
 L Harris
| 7 | 3 | 6 | L Harris
| 2 | 3 | |||||||||||||||||||||
| Q |  BT Botzer
| 5 | 6 | 0 | 1 | K Khachanov
| 77 | 6 | |||||||||||||||||||
 B Trinker
| 1 | 0 |  I Ivashka
| 65 | 3 | ||||||||||||||||||||||
| I Ivashka
| 6 | 6 | I Ivashka
| 4 | 78 | 6 | |||||||||||||||||||||
 M Tepavac
| 6 | 6 | M Tepavac
| 6 | 66 | 3 | |||||||||||||||||||||
| 8 | E López Pérez
| 3 | 2 | 1 | K Khachanov
| 6 | 0 | ||||||||||||||||||||
| 4 | J Samper-Montaña
| 6 | 6 | A Velotti
| 2 | 0r | |||||||||||||||||||||
| WC |  Shonigmatjon Shofayziyev
| 3 | 1 | 4 | J Samper-Montaña
| 6 | 4 | 0 | |||||||||||||||||||
| A Velotti
| 6 | 6 | A Velotti
| 3 | 6 | 6 | |||||||||||||||||||||
| WC | T Ismailov
| 4 | 1 | A Velotti
| 6 | 5 | 6 | ||||||||||||||||||||
| Q | M Elgin
| 5 | 4 |  FF Silva
| 3 | 7 | 4 | ||||||||||||||||||||
| FF Silva
| 7 | 6 | FF Silva
| 78 | 6 | ||||||||||||||||||||||
 A Metreveli
| 2 | 3 | 6 |  D Popko
| 66 | 1 | |||||||||||||||||||||
| 6 | D Popko
| 6 | 6 | ||||||||||||||||||||||||
Bottom half
edit| First round | Second round | Quarterfinals | Semifinals | ||||||||||||||||||||||||
| 5 | F Dustov
| 1 | 0r | ||||||||||||||||||||||||
| R Ramírez Hidalgo
| 6 | 0 | R Ramírez Hidalgo
| 6 | 6 | ||||||||||||||||||||||
| WC | Pavel Tsoy
| 62 | 1 |  Y Uchiyama
| 1 | 4 | |||||||||||||||||||||
| Y Uchiyama
| 77 | 6 | R Ramírez Hidalgo
| 6 | 6 | ||||||||||||||||||||||
| A Bega
| 6 | 7 | 3 | A Weintraub
| 2 | 4 | |||||||||||||||||||||
 N Barrientos
| 3 | 5 | A Bega
| 6 | 4 | 2 | |||||||||||||||||||||
 C Zampieri
| 77 | 2 | 4 | 3 | A Weintraub
| 3 | 6 | 6 | |||||||||||||||||||
| 3 | A Weintraub
| 64 | 6 | 6 | R Ramírez Hidalgo
| 2 | 77 | 77 | |||||||||||||||||||
| 7 | N Milojević
| 6 | 5 | 1 | R Ramanathan
| 6 | 65 | 60 | |||||||||||||||||||
 S Diez
| 3 | 7 | 6 | S Diez
| 5 | 3 | |||||||||||||||||||||
| Q | M Kalovelonis
| 4 | 3 | R Ramanathan
| 7 | 6 | |||||||||||||||||||||
| R Ramanathan
| 6 | 6 | R Ramanathan
| 6 | 6 | ||||||||||||||||||||||
| WC | S Fayziev
| 4 | 5 | 2 |  R Albot
| 4 | 4 | ||||||||||||||||||||
| A Karatsev
| 6 | 7 | A Karatsev
| 64 | 7 | 2 | |||||||||||||||||||||
 T-h Yang
| 63 | 4 | 2 | R Albot
| 77 | 5 | 6 | ||||||||||||||||||||
| 2 | R Albot
| 77 | 6 | ||||||||||||||||||||||||